El Pirineu és un territori gran i variat climàticament, cosa que fa que la fauna siga molt variada de zona en zona. En total, existeixen 42 espècies de mamífers. Al País Basc, el potok o cavall pirinenc hi és simbòlic. Mentrestant, a gran part del Pirineu central, l’ós bru és l’animal més associat, malgrat que en queden ben pocs. D’altres espècies típiques, però no exclusives del Pirineu són: el xoriguer gros, la marmota, el porc senglar, l’isard, el llop, el cérvol, el linx, l’àguila o el falcó.